三、伏斷位次：滅現行名伏，除種子及習氣名斷。斷的意義，約能斷說，是除害義；約所斷說，是不續義；自類相生的種子后生的作用不相續，即是斷惑。過去未來的法無體，故無所斷；現在惑智俱起，亦無所斷；但由教行因緣引起正見相應的能治心，此心生時，所治惑種即滅，智生惑滅同一剎那，猶如世間明生暗滅，斷惑義成。煩惱所知的分別二障，資糧位漸伏，加行位頓伏。少分伏名漸伏，猶有余故；全分伏名頓伏，更無余故。資糧位伏其粗者，由勝解力折伏；加行位伏其細者，由四尋思四如實觀制伏。因邪師邪教所引起的名粗，由自分別所引起的細。分別二障的種子與習氣，俱初地斷；即于真見道位中的無間道斷除種子，解脫道斷除習氣。
俱生煩惱障種，亦即修道所斷的煩惱障種，由于不障十地，和菩薩須留惑濟生，所以不除，但伏現行不起，直待將成佛時，金剛喻定現在前時一切頓斷。習氣則于十地間地地除之。總起來說，俱生煩惱的現行，地前漸伏，以道力微劣，失念的時候，煩惱現行尚得起故。初地以上，能頓伏盡，如同阿羅漢一樣，令永不現行。但菩薩為了化度眾生，在前七地中，由故意力，使煩惱種子暫生現行，雖暫現起，而不為過失。如《解深密經》說：‘是諸菩薩于初地中，定于一切諸法法界已善通達；由因此緣，菩薩要知方起煩惱，非為不知，是故說名無染污相。于自身中，不能生苦，故無過失。菩薩生起如是煩惱，于有情界能斷苦因，是故彼有無量功德。’但應該知道，故起煩惱的，是不怖煩惱的悲增菩薩。有怖煩惱的智增菩薩，則不起煩惱。到八地以上，道力勝故，純是無漏觀心相續生起，則無論是智增菩薩與悲增菩薩，煩惱都畢竟永不現行了。
俱生所知障種，亦即修道所斷的所知障種，于十地中漸次斷滅，金剛喻定現在前時才永斷盡。習氣則于解脫道中永斷。此障的現行，地前加行位能漸制伏，乃至十地才永伏盡。八地以上，與前六識俱起者，不復現行；無漏觀心及果相續，違彼障故。無漏觀心即第六識中人法二空相本智，果即后得與滅盡定。八地以上，人空無漏恒時相續無有間斷，法空無漏多分相續少分間斷，故能令第六識中法空無漏不起的時候，唯人空無漏現前，對第七識法執來說，即為粗觀，不能制伏細執，故第七識俱生的法執，仍能現行。若法空無漏智及彼所引起的后得智和滅盡定位，則能伏令不起。茲將俱生二障的伏斷地位表示